น้ำมันถั่วเหลืองอุดมไปด้วยกรดไลโนเลอิก กรดไลโนเลอิก (linoleic acid) เป็นกรดไขมันจำเป็นในร่างกายมนุษย์ซึ่งมีหน้าที่ทางสรีรวิทยาที่สำคัญ เด็กขาดกรดไลโนเลอิก ผิวหนังจะแห้ง เกล็ดหนาขึ้น ชะลอการเจริญเติบโต ผู้สูงอายุขาดกรดไลโนเลอิก ทำให้เกิดต้อกระจก และโรคหลอดเลือดหัวใจได้ น้ำมันถั่วเหลืองดิบมีรสคล้ายถั่ว ซึ่งสามารถเอาออกได้หลังจากการกลั่น แต่มีแนวโน้มที่จะมีกลิ่นค้างอยู่ในคอระหว่างการเก็บรักษา เนื่องจากมีกรดไลโนเลนิกและกรดไอโซลิโนเลอิก ปริมาณกรดไลโนเลนิกจึงลดลงเหลือน้อยที่สุดโดยการคัดเลือกไฮโดรจิเนชัน และ "รสที่ค้างอยู่ในคอ" ของน้ำมันถั่วเหลืองโดยทั่วไปสามารถกำจัดได้โดยการหลีกเลี่ยงการสร้างกรดไอโซลิโนเลอิก น้ำมันถั่วเหลืองบริสุทธิ์เปลี่ยนสีจากสีอ่อนเป็นสีเข้มในระหว่างการเก็บรักษาระยะยาว ปรากฏการณ์ที่เรียกว่า “การคืนสี” การนำสีของน้ำมันถั่วเหลืองกลับมาใช้ใหม่ได้ชัดเจนกว่าน้ำมันชนิดอื่น ปัญหานี้สามารถแก้ไขได้โดยวิธีเก็บความสดแบบเติมไนโตรเจน หรือแยกน้ำมันออกจากอากาศให้มากที่สุด
1. ตรวจสอบสภาพการหล่อลื่นของ เครื่องสกัดน้ำมันถั่วเหลือง หลังจากทำงานครบ 50 ชั่วโมง ถ้วยน้ำมันบนกล่องเกียร์จะต้องไม่ขาดน้ำมัน
2. ชิ้นส่วนหล่อลื่นทั้งหมดของเครื่องสกัดน้ำมันถั่วเหลืองควรได้รับการป้องกันจากฝุ่นและสิ่งสกปรกอื่น ๆ ควรตรวจสอบคุณภาพน้ำมันของกล่องเกียร์ของเครื่องสกัดน้ำมันถั่วเหลืองปีละครั้ง
3. เมื่อปริมาณการผลิตของเครื่องสกัดน้ำมันถั่วเหลืองลดลง และผลผลิตกากหรือน้ำมันผิดปกติ ควรนำเพลาสกรูของเครื่องสกัดน้ำมันออกเพื่อตรวจสอบการสึกหรอของสกรู แถบกด และวงแหวนกากของเครื่องสกัดน้ำมันถั่วเหลือง และเปลี่ยนชิ้นส่วนที่สึกหรอให้ทันเวลา
4. หลังจากสิ้นสุดกะการผลิตแต่ละครั้ง ควรกำจัดกากถั่วเหลืองที่ตกค้างในเครื่องสกัดน้ำมันถั่วเหลือง และทำความสะอาดฝุ่นและคราบน้ำมันบนพื้นผิวของเครื่องสกัดน้ำมัน
5. หลังจากเก็บรักษาเป็นเวลานานเมื่อสิ้นสุดฤดูการผลิต ควรทำการบำรุงรักษาหนึ่งครั้ง และถอดสกรูแถบกดและวงแหวนของเครื่องสกัดน้ำมันออก ล้างและทาน้ำมันอีกครั้ง และเก็บไว้ในที่แห้ง
